玛蒂娜·布雷默
教授
统计,生物统计学
408-924-1396
martina.bremer@sjsu.edu
MH 318
研究领域
- 统计数据
- 生物信息学
传记
我是一名统计学家,对生物信息学感兴趣。特别是,我对微阵列数据的分析和解释感兴趣。DNA微阵列(或基因芯片)存在于许多生物体中——动物、植物和人类。它们被用来测量在任何给定时间内许多基因(人类大约有30,000个蛋白质编码基因)被“激活”的程度。研究人员对测量基因表达感兴趣,以研究哪些基因与特定疾病(如癌症)有关。
基因受到许多因素的影响:生物体受到的外部因素(例如,植物的干旱或人类的疾病),但基因和蛋白质也在一个复杂的网络中相互影响。是否有可能在微阵列数据中识别由其他基因或蛋白质向上或向下调节的基因?在我的论文中,我使用基因调控的状态空间模型来研究这个问题。
出版物
- Harsh Bhatia, Attila G. Gyulassy, Valerio Pascucci, Martina Bremer, Mitchell T. Ong, Vincenzo Lordi, Erik W. Draeger, John E. Pask和peter - timo Bremer。通过相对角度分布和相关不确定性的原子轨迹交互探索[pdf]。第9届IEEE太平洋可视化研讨会论文集,页120-127,台北,台湾。2016年4月19日至22日。
- M. Bremer, R.W. Doerge,在工作台上使用R -生物学家一步一步的数据分析,冷泉港出版社,2015。
- 阮金平,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军,李建军。百日咳的延迟反应。PLOS One, 2012年12月,第7卷,第12期。
- 黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强,黄志强。天然产品通讯,7(10),2012。
- N.J. Tarlton, C.M. Green, N.H. Lazarus, L. Rott, A.P. Wong, O.N. Abramson, m.b remer, E.C. Butcher, t.a ramson,儿童溃疡性结肠炎血浆分离频率和转运受体表达的改变。炎症性肠病,2012年4月5日。
- 杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军,杨建军。
- A. madlung, M. Bremer, E. Himelblau, A. Tullis,数学-生物跨学科教育的潜在负面影响评估研究,CBE生命科学教育,第10卷,43 - 54,2011年春季。
- M. Bremer & R.W. Doerge,《板凳上的统计:生物学家一步一步的手册》,冷泉港出版社,2010年
- M. Bremer, E. Himelblau, A. Madlung,介绍双色微阵列数据的统计分析(书中的章节),Bang, H, Zhou, XK, Van Epps, H, Mazumdar, M.(编辑)分子生物学的统计方法。人类出版社,2010。
- M. Bremer和R.W. Doerge, km -算法在时间序列表达数据中的识别,生物信息学进展,2009