Cleber Ouverney

Cleber Ouverney408-924-4806
cleber.ouverney@sjsu.edu
该校554年

Ouverney实验室

关于办公时间，请查看本学术指导页面的底部。

如果你需要学术指导，请给我发邮件更新你的4年计划。

生物学系列春季研讨会2025（时间表待定）

教育

  • 博士后，2005年-斯坦福大学医学院和福赛斯研究所
  • 博士，1999年-南加州大学
  • 硕士，1993年-加州州立大学东湾分校
  • 学士学位，1990年-西方学院

研究兴趣

奥弗尼实验室试图通过类型和功能来描述天然微生物群落中细菌的多样性。超过99%的微生物被认为是不可培养的，因此我们主要依靠非培养的分子方法来收集关于混合微生物群落的组成和作用的信息。在环境样本中发现的一些不可培养的细菌在人类中具有遗传对应物，其中一些细菌最近与人类疾病有关。我们的研究旨在发现与人类相关的不可培养细菌的自然来源，并更好地了解这些细菌在各自群落中的功能。为了鉴定细菌，我们依靠DNA测序，包括下一代测序平台。为了研究微生物的功能，我们结合了原位杂交和显微放射自显影术（STARFISH）来测量细菌生长所需的营养物质类型。通过了解细菌生长所需的条件，可以在医学上应用于抑制潜在病原体的生长。

出版物

  • cokerham， S, B Lee, RA Orben, RM Suryan, LG Torres, P Warzybok, R Bradley, J Jahncke, HS Young, C Ouverney， S. Shaffer。2019。西方海鸥（Larus occidentalis）的微生物生态学。J.微生物生态学。p. 665-676。
  • 欧文尼，C. 2016。结合显微放射自显影和荧光原位杂交（FISH）在单细胞水平评价原核生物活性。[2]李春华，李春华，李春华，《环境微生物学手册》第4版。ASM出版社，华盛顿特区，第2.2.2-1-2.2.2页（书章，美国微生物学会）。
  • 考德威尔，a.c.， L.C.菲德萨莱斯·席尔瓦，C.C.达·席尔瓦，C.C.奥弗尼，2015。巴西有机、集约化和过渡咖啡农场根际原核生物多样性。科学通报，10(6):10106355。doi: 10.1371 / journal.pone.0106355
  • Dinis JM, DE Barton, J Ghadiri, D Surendar, K Reddy, F Velasquez, CL Chaffee, MC Lee, H Gavrilova, H Ozuna， SA Smits和CC Ouverney。2011。在环境中寻找未培养的人类相关TM7细菌。PLoS ONE 6(6): e21280。doi: 10.1371 / journal.pone.0021280
  • Smits SA和CC Ouverney。2010。从序列关系网络的角度推断系统发育树的管道。生物信息学杂志，11（增刊6）：518。doi: 10.1186 / 1471 - 2105 - 11 - s18 s6 -美国。
  • Smits SA和CC Ouverney。2010。jsPhyloSVG：一个用于在Web上可视化交互式和基于矢量的系统发育树的Javascript库。科学通报，5(8):1267。doi: 10.1371 / journal.pone.0012267
  • 马西，Y， C。EM Bik, T Lösekann, N Ivanova, HG Martin, E Szeto, D Platt, P Hugenholtz, DA Relman, SR Quake. 2007。通过对人类口腔中罕见的未培养TM7微生物的单细胞遗传分析，解剖生物学“暗物质”。Pnas 104(29): 11889-94。
  • 琼斯，BW, A Maruyama， CC Ouverney和MK Nishiguchi。2007。夏威夷、澳大利亚和法国沿海水域弧菌科的时空分布。微生物生态学，54:pp
  • 欧文尼，CC, GC Armitage，和DA Relman. 2004。利用克隆人工靶鱼（catFISH）优化与16S rRNA克隆的寡核苷酸探针杂交条件原位未培养的原变性细胞的定量。在G. A. Kowalchuk， F. J. de Bruijn， I. M. Head， A. D. L . Akkermans和J. D. van Elsas，编辑。分子微生物生态学手册，第二版。第3.12章：727-742-169Kluwer学术出版社，多德雷赫特。
  • 傅尔曼，2004。通过海星分析混合天然微生物群落中单细胞计数与功能的关系。在G. A. Kowalchuk， F. J. de Bruijn， I. M. Head， A. D. L. Akkermans和J. D. van Elsas，编辑。分子微生物生态学手册，第二版。8.08: 1689-1710。Kluwer学术出版社，多德雷赫特
  • Lepp， PW, MM bringing, CC Ouverney, K Palm， GC Armitage和DA Relman. 2004。产甲烷古菌与人类牙周病。中国生物医学工程学报，2011(6):391 - 391。
  • 欧文尼，C. C.阿米蒂奇，D. A.雷尔曼，2003。人龈下间隙未培养TM7亚群的单细胞计数。环境科学学报，2016,35(6):444 - 444。
  • 马华，M, A Herbay, DN Fredricks, CC Ouverney， JC Kosek和DA Relman。2003。的培养Tropheryma whipplei来自脑脊液中华传染病杂志，18(2):391 - 398。
  • m, m, PW Lepp, CC Ouverney， GC Armitage和DA Relman. 2003。龈下菌斑TM7菌群的流行及其与疾病的关系环境科学学报，2009 (3):387 - 394
  • 欧文尼，CC和JA福尔曼。2000。海洋浮游生物古菌吸收氨基酸。环境科学与技术，2016 (11):379 - 379
  • 欧文尼，CC和JA Fuhrman。1999。显微放射自显影- 16s rRNA探针联合技术测定特定微生物细胞类型的放射性同位素摄取原位． 微生物学通报，2014(4):444 - 444。
  • 《中华人民共和国宪法》，1999。通过FISH和STARFISH解析海洋浮游细菌“黑匣子”的类型和功能，博士学位论文，南加州大学。
  • Fuhrman， JA和CC Ouverney. 1998。利用16S rRNA序列研究海洋微生物多样性：利用荧光单细胞探针对海岸原生古菌的克隆结果和计数。水生生态学。32:3-5
  • 欧文尼，CC和JA福尔曼。1997。16S rRNA荧光强度增加原位用氯霉素处理天然样品的杂交。环境科学学报，2016,35(6):557 - 557。