穆罕默德,Abdulmelik

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Abdulmelik Mohammed是生物医学工程系的助理教授，他的研究重点是自然和合成生物分子系统的计算建模和分析。他在芬兰阿尔托大学获得理学博士学位，其关于生物分子纳米结构的算法设计的论文获得了科学学院的论文奖。在加入上海外国语大学之前，他是南佛罗里达大学数学与统计系的博士后。

研究兴趣

计算建模，生物分子系统的设计和分析，生物分子纳米技术，计算基因组学。

电子邮件

首选:abdulmelik.mohammed@sjsu.edu

电话

首选:408-924-3833

教育

  • 科学（技术）博士，阿尔托大学，芬兰
  • 科学（技术）硕士，阿尔托大学，芬兰
  • 芬兰城市应用科学大学工学学士

生物

刊物一览表

  • Elonen， A., Mohammed， A., & Orponen， P.（2024）。无支架DNA线框纳米结构的一般设计方法。非常规计算与自然计算国际会议（UCNC24）论文集（LNCS第14776卷，第178-189页）。施普林格。https://doi.org/10.1007/978-3-031-63742-1_13​ 
  • Elonen， A., Wimbes， L., Mohammed， A., and Orponen， P.（2024）。核酸线框纳米结构的设计工具。核酸研究， 52(w1), w13-w18。https://doi.org/10.1093/nar/gkae367​ 
  • Elonen， A., Natarajan, a.k., Kawamata， I., Oesinghaus， L., Mohammed， A., Seitsonen， J., Suzuki， Y., Simmel, f.c, Kuzyk， A., & Orponen， P.（2022）。三维线框RNA多面体的算法设计。ACS Nano， 16(10), 16608-16616。https://doi.org/10.1021/acsnano.2c06035 
  • Mohammed， A., Jonoska， N., & Saito， M.（2020）。非球面网格线框图上支架布线的拓扑结构。第26届DNA计算与分子编程国际会议论文集（DNA 26）（第174卷，第1-17页）https://doi.org/10.4230/LIPIcs.DNA.2020.1​ 
  • Mohammed， A., Orponen， P., & Pai， S.（2018）。共转录折叠二维RNA折纸结构的算法设计。非常规计算与自然计算国际会议（UCNC18）论文集（LNCS第10867卷，第159-172页）。施普林格。https://doi.org/10.1007/978-3-319-92435-9_12​ 
  • Benson， E., Mohammed， A., Rayneau-Kirkhope， D., Gadin， A., Orponen， P., and Högberg， B.（2018）。设计选择对线框DNA折纸结构刚度的影响。ACS Nano生态学报，12(9),9291-9299。https://doi.org/10.1021/acsnano.8b04148​ 
  • Mohammed， A., & Hajij， M.（2017）。三角网的未打结线路线。第23届国际DNA计算与分子编程会议论文集(第10467卷，第46-63页)。施普林格。https://doi.org/10.1007/978-3-319-66799-7_4​ 
  • Mohammed， A., Czeizler， E., & Czeizler， E.（2017）。采用基于规则的方法对动态瓦片装配模型进行计算建模。理论计算机科学生物医学工程学报，7(1),203-215。https://doi.org/10.1016/j.tcs.2017.07.014​ 
  • Benson， E., Mohammed， A., Bosco， A., Teixeira， A. I., Orponen， P., and Högberg， B.（2016）。用计算机辅助从平板网格中制造脚手架DNA纳米结构。《应用化学》生物医学工程学报，55(31),8869-8872。https://doi.org/10.1002/anie.201602446​ 
  • Benson， E, Mohammed， A., Gardell， J., Masich， S., Czeizler， E., Orponen， P., & Högberg， B.（2015）。纳米尺度下多面体网格的DNA绘制。自然,523(7561), 441 - 444。https://doi.org/10.1038/nature14586​ 

荣誉及奖励

  • AMS-Simons旅行补助金（2020）
  • 阿尔托大学论文奖（2019）
  • 诺基亚基金会奖学金（2017）
  • 诺基亚基金会奖学金（2015）
  • 赫尔辛基信息通信技术博士教育网络（HICT）博士生（2014-2018）
  • 阿尔托理学院硕士论文奖（2014）

授课

  • BME 115 - BME的基础
  • 生物医学工程中的数值方法
  • BME 165 -应用工程生物力学
  • BME 291 -硕士论文/项目准备研讨会

链接

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